Bối cảnh game Metal Mutation là kỷ nguyên tương lai, nơi các bộ phận giả cơ học và AI cực kỳ phát triển. Một loại đột biến kim loại do virus nano gây ra đã nhấn chìm nhân loại xuống vực sâu. Đã đến lúc bạn phải chiến đấu chống lại đột biến kim loại này để giải cứu thế giới. Và đó là lúc chuyến phiêu lưu trong Metal Mutation game bắt đầu…